Protein–RNA interactions for Protein: P09017

HOXC4, Homeobox protein Hox-C4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC4P09017 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms