Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOP08100 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOP08100 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOP08100 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOP08100 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOP08100 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOP08100 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOP08100 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOP08100 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOP08100 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOP08100 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOP08100 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOP08100 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOP08100 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOP08100 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOP08100 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOP08100 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOP08100 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOP08100 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOP08100 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOP08100 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOP08100 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOP08100 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOP08100 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOP08100 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOP08100 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOP08100 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOP08100 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOP08100 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOP08100 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOP08100 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOP08100 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOP08100 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOP08100 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOP08100 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOP08100 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOP08100 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOP08100 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOP08100 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOP08100 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOP08100 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOP08100 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOP08100 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOP08100 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOP08100 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOP08100 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOP08100 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOP08100 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOP08100 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOP08100 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOP08100 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOP08100 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOP08100 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOP08100 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms