Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPBP07199 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPBP07199 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPBP07199 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPBP07199 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPBP07199 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPBP07199 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPBP07199 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPBP07199 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPBP07199 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPBP07199 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPBP07199 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPBP07199 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBP07199 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBP07199 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBP07199 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBP07199 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBP07199 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBP07199 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBP07199 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBP07199 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBP07199 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBP07199 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBP07199 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBP07199 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBP07199 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBP07199 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBP07199 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBP07199 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBP07199 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBP07199 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBP07199 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBP07199 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBP07199 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBP07199 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBP07199 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBP07199 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBP07199 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBP07199 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBP07199 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBP07199 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBP07199 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBP07199 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBP07199 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBP07199 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBP07199 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBP07199 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBP07199 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBP07199 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBP07199 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPBP07199 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPBP07199 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPBP07199 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPBP07199 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPBP07199 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPBP07199 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPBP07199 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPBP07199 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPBP07199 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPBP07199 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPBP07199 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPBP07199 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPBP07199 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPBP07199 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPBP07199 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPBP07199 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPBP07199 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPBP07199 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPBP07199 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPBP07199 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPBP07199 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPBP07199 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPBP07199 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPBP07199 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPBP07199 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPBP07199 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPBP07199 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPBP07199 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CENPBP07199 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CENPBP07199 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPBP07199 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPBP07199 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPBP07199 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPBP07199 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPBP07199 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPBP07199 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPBP07199 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPBP07199 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPBP07199 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPBP07199 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPBP07199 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPBP07199 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPBP07199 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPBP07199 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPBP07199 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPBP07199 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPBP07199 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPBP07199 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPBP07199 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPBP07199 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms