Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms