Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms