Protein–RNA interactions for Protein: O95206

PCDH8, Protocadherin-8, humanhuman

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Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH8O95206 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH8O95206 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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