Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms