Protein–RNA interactions for Protein: E9PQ53

NDUFC2-KCTD14, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2, isoform 2, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NDUFC2-KCTD14E9PQ53 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms