Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms