Protein–RNA interactions for Protein: C9J366

IQCJ-SCHIP1, IQCJ-SCHIP1 readthrough, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCJ-SCHIP1C9J366 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IQCJ-SCHIP1C9J366 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IQCJ-SCHIP1C9J366 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IQCJ-SCHIP1C9J366 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IQCJ-SCHIP1C9J366 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IQCJ-SCHIP1C9J366 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IQCJ-SCHIP1C9J366 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IQCJ-SCHIP1C9J366 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IQCJ-SCHIP1C9J366 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IQCJ-SCHIP1C9J366 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IQCJ-SCHIP1C9J366 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IQCJ-SCHIP1C9J366 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms