Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DGG1 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DGG1 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DGG1 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DGG1 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DGG1 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DGG1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DGG1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DGG1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DGG1 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DGG1 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DGG1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DGG1 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DGG1 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DGG1 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DGG1 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DGG1 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DGG1 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DGG1 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DGG1 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DGG1 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DGG1 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DGG1 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DGG1 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DGG1 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DGG1 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DGG1 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DGG1 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms