Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms