Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms