Protein–RNA interactions for Protein: R4GN57

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R4GN57 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
R4GN57 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
R4GN57 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
R4GN57 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
R4GN57 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
R4GN57 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
R4GN57 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
R4GN57 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
R4GN57 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
R4GN57 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
R4GN57 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
R4GN57 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
R4GN57 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
R4GN57 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
R4GN57 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
R4GN57 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
R4GN57 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
R4GN57 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
R4GN57 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
R4GN57 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
R4GN57 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
R4GN57 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
R4GN57 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
R4GN57 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
R4GN57 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R4GN57 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
R4GN57 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
R4GN57 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R4GN57 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
R4GN57 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
R4GN57 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
R4GN57 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R4GN57 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
R4GN57 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
R4GN57 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
R4GN57 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
R4GN57 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
R4GN57 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
R4GN57 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
R4GN57 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
R4GN57 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
R4GN57 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
R4GN57 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
R4GN57 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
R4GN57 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
R4GN57 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
R4GN57 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
R4GN57 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
R4GN57 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
R4GN57 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
R4GN57 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
R4GN57 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
R4GN57 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
R4GN57 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
R4GN57 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
R4GN57 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
R4GN57 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
R4GN57 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
R4GN57 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
R4GN57 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
R4GN57 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
R4GN57 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
R4GN57 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
R4GN57 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
R4GN57 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
R4GN57 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
R4GN57 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
R4GN57 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
R4GN57 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
R4GN57 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
R4GN57 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
R4GN57 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
R4GN57 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
R4GN57 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
R4GN57 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
R4GN57 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
R4GN57 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
R4GN57 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
R4GN57 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
R4GN57 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
R4GN57 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
R4GN57 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
R4GN57 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
R4GN57 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
R4GN57 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
R4GN57 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
R4GN57 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
R4GN57 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
R4GN57 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
R4GN57 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
R4GN57 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
R4GN57 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
R4GN57 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
R4GN57 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
R4GN57 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
R4GN57 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
R4GN57 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
R4GN57 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
R4GN57 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
R4GN57 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms