Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X4

FAM169A, Soluble lamin-associated protein of 75 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM169AQ9Y6X4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM169AQ9Y6X4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM169AQ9Y6X4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FAM169AQ9Y6X4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM169AQ9Y6X4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms