Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6S9

RPS6KL1, Ribosomal protein S6 kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1Q9Y6S9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RPS6KL1Q9Y6S9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 222.7 ms