Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N9

USH1C, Harmonin, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USH1CQ9Y6N9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USH1CQ9Y6N9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms