Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LINC00312Q9Y6C7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LINC00312Q9Y6C7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LINC00312Q9Y6C7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms