Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y639

NPTN, Neuroplastin, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTNQ9Y639 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
NPTNQ9Y639 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms