Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K1

SPO11, Meiotic recombination protein SPO11, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPO11Q9Y5K1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPO11Q9Y5K1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPO11Q9Y5K1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPO11Q9Y5K1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPO11Q9Y5K1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPO11Q9Y5K1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPO11Q9Y5K1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPO11Q9Y5K1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPO11Q9Y5K1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPO11Q9Y5K1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPO11Q9Y5K1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPO11Q9Y5K1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SPO11Q9Y5K1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPO11Q9Y5K1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPO11Q9Y5K1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPO11Q9Y5K1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPO11Q9Y5K1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPO11Q9Y5K1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPO11Q9Y5K1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPO11Q9Y5K1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPO11Q9Y5K1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPO11Q9Y5K1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPO11Q9Y5K1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPO11Q9Y5K1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SPO11Q9Y5K1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPO11Q9Y5K1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPO11Q9Y5K1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPO11Q9Y5K1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPO11Q9Y5K1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPO11Q9Y5K1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPO11Q9Y5K1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPO11Q9Y5K1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPO11Q9Y5K1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPO11Q9Y5K1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPO11Q9Y5K1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPO11Q9Y5K1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPO11Q9Y5K1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPO11Q9Y5K1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPO11Q9Y5K1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPO11Q9Y5K1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SPO11Q9Y5K1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SPO11Q9Y5K1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPO11Q9Y5K1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPO11Q9Y5K1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPO11Q9Y5K1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPO11Q9Y5K1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPO11Q9Y5K1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPO11Q9Y5K1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPO11Q9Y5K1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPO11Q9Y5K1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPO11Q9Y5K1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPO11Q9Y5K1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPO11Q9Y5K1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPO11Q9Y5K1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SPO11Q9Y5K1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPO11Q9Y5K1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPO11Q9Y5K1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPO11Q9Y5K1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPO11Q9Y5K1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPO11Q9Y5K1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPO11Q9Y5K1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPO11Q9Y5K1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
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