Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y375

NDUFAF1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF1Q9Y375 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFAF1Q9Y375 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFAF1Q9Y375 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFAF1Q9Y375 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFAF1Q9Y375 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFAF1Q9Y375 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFAF1Q9Y375 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFAF1Q9Y375 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFAF1Q9Y375 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFAF1Q9Y375 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFAF1Q9Y375 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NDUFAF1Q9Y375 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NDUFAF1Q9Y375 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms