Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I7

PIKFYVE, 1-phosphatidylinositol 3-phosphate 5-kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIKFYVEQ9Y2I7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIKFYVEQ9Y2I7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIKFYVEQ9Y2I7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIKFYVEQ9Y2I7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIKFYVEQ9Y2I7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIKFYVEQ9Y2I7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIKFYVEQ9Y2I7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PIKFYVEQ9Y2I7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PIKFYVEQ9Y2I7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIKFYVEQ9Y2I7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIKFYVEQ9Y2I7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIKFYVEQ9Y2I7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIKFYVEQ9Y2I7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIKFYVEQ9Y2I7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIKFYVEQ9Y2I7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIKFYVEQ9Y2I7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIKFYVEQ9Y2I7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PIKFYVEQ9Y2I7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIKFYVEQ9Y2I7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIKFYVEQ9Y2I7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIKFYVEQ9Y2I7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIKFYVEQ9Y2I7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIKFYVEQ9Y2I7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIKFYVEQ9Y2I7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIKFYVEQ9Y2I7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIKFYVEQ9Y2I7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PIKFYVEQ9Y2I7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PIKFYVEQ9Y2I7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PIKFYVEQ9Y2I7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms