Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNNQ9UQP3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNNQ9UQP3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNNQ9UQP3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNNQ9UQP3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNNQ9UQP3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNNQ9UQP3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNNQ9UQP3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNNQ9UQP3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TNNQ9UQP3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TNNQ9UQP3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TNNQ9UQP3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TNNQ9UQP3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNNQ9UQP3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNNQ9UQP3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNNQ9UQP3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNNQ9UQP3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNNQ9UQP3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNNQ9UQP3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TNNQ9UQP3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNNQ9UQP3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNNQ9UQP3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNNQ9UQP3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TNNQ9UQP3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TNNQ9UQP3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TNNQ9UQP3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TNNQ9UQP3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TNNQ9UQP3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TNNQ9UQP3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TNNQ9UQP3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TNNQ9UQP3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
TNNQ9UQP3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
TNNQ9UQP3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
TNNQ9UQP3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
TNNQ9UQP3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNNQ9UQP3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNNQ9UQP3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNNQ9UQP3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNNQ9UQP3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNNQ9UQP3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNNQ9UQP3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNNQ9UQP3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNNQ9UQP3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNNQ9UQP3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNNQ9UQP3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNNQ9UQP3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNNQ9UQP3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNNQ9UQP3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNNQ9UQP3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNNQ9UQP3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNNQ9UQP3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TNNQ9UQP3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNNQ9UQP3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNNQ9UQP3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNNQ9UQP3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms