Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ84

EXO1, Exonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXO1Q9UQ84 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXO1Q9UQ84 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms