Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
IGSF9BQ9UPX0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
IGSF9BQ9UPX0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IGSF9BQ9UPX0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IGSF9BQ9UPX0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IGSF9BQ9UPX0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IGSF9BQ9UPX0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IGSF9BQ9UPX0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IGSF9BQ9UPX0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IGSF9BQ9UPX0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IGSF9BQ9UPX0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IGSF9BQ9UPX0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IGSF9BQ9UPX0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IGSF9BQ9UPX0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IGSF9BQ9UPX0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IGSF9BQ9UPX0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
IGSF9BQ9UPX0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IGSF9BQ9UPX0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
IGSF9BQ9UPX0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
IGSF9BQ9UPX0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IGSF9BQ9UPX0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IGSF9BQ9UPX0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IGSF9BQ9UPX0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IGSF9BQ9UPX0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IGSF9BQ9UPX0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IGSF9BQ9UPX0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IGSF9BQ9UPX0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IGSF9BQ9UPX0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IGSF9BQ9UPX0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IGSF9BQ9UPX0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IGSF9BQ9UPX0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IGSF9BQ9UPX0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IGSF9BQ9UPX0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IGSF9BQ9UPX0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IGSF9BQ9UPX0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IGSF9BQ9UPX0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IGSF9BQ9UPX0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IGSF9BQ9UPX0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IGSF9BQ9UPX0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IGSF9BQ9UPX0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IGSF9BQ9UPX0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IGSF9BQ9UPX0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IGSF9BQ9UPX0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IGSF9BQ9UPX0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
IGSF9BQ9UPX0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IGSF9BQ9UPX0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IGSF9BQ9UPX0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IGSF9BQ9UPX0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGSF9BQ9UPX0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGSF9BQ9UPX0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGSF9BQ9UPX0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
IGSF9BQ9UPX0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGSF9BQ9UPX0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IGSF9BQ9UPX0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IGSF9BQ9UPX0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IGSF9BQ9UPX0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IGSF9BQ9UPX0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IGSF9BQ9UPX0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
IGSF9BQ9UPX0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IGSF9BQ9UPX0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IGSF9BQ9UPX0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IGSF9BQ9UPX0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IGSF9BQ9UPX0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGSF9BQ9UPX0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGSF9BQ9UPX0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGSF9BQ9UPX0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGSF9BQ9UPX0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IGSF9BQ9UPX0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IGSF9BQ9UPX0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IGSF9BQ9UPX0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IGSF9BQ9UPX0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
IGSF9BQ9UPX0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
IGSF9BQ9UPX0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IGSF9BQ9UPX0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IGSF9BQ9UPX0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IGSF9BQ9UPX0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IGSF9BQ9UPX0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IGSF9BQ9UPX0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IGSF9BQ9UPX0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IGSF9BQ9UPX0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IGSF9BQ9UPX0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IGSF9BQ9UPX0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IGSF9BQ9UPX0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IGSF9BQ9UPX0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
IGSF9BQ9UPX0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IGSF9BQ9UPX0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IGSF9BQ9UPX0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IGSF9BQ9UPX0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IGSF9BQ9UPX0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IGSF9BQ9UPX0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IGSF9BQ9UPX0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IGSF9BQ9UPX0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms