Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRAK1Q9UPV9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRAK1Q9UPV9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRAK1Q9UPV9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRAK1Q9UPV9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRAK1Q9UPV9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRAK1Q9UPV9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRAK1Q9UPV9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRAK1Q9UPV9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRAK1Q9UPV9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRAK1Q9UPV9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRAK1Q9UPV9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRAK1Q9UPV9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRAK1Q9UPV9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRAK1Q9UPV9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRAK1Q9UPV9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRAK1Q9UPV9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRAK1Q9UPV9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
TRAK1Q9UPV9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
TRAK1Q9UPV9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRAK1Q9UPV9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRAK1Q9UPV9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRAK1Q9UPV9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRAK1Q9UPV9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRAK1Q9UPV9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRAK1Q9UPV9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRAK1Q9UPV9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRAK1Q9UPV9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRAK1Q9UPV9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRAK1Q9UPV9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRAK1Q9UPV9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRAK1Q9UPV9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
TRAK1Q9UPV9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRAK1Q9UPV9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRAK1Q9UPV9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRAK1Q9UPV9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRAK1Q9UPV9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRAK1Q9UPV9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRAK1Q9UPV9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRAK1Q9UPV9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRAK1Q9UPV9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TRAK1Q9UPV9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
TRAK1Q9UPV9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TRAK1Q9UPV9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TRAK1Q9UPV9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TRAK1Q9UPV9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
TRAK1Q9UPV9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TRAK1Q9UPV9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TRAK1Q9UPV9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TRAK1Q9UPV9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
TRAK1Q9UPV9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TRAK1Q9UPV9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
TRAK1Q9UPV9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TRAK1Q9UPV9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRAK1Q9UPV9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
TRAK1Q9UPV9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRAK1Q9UPV9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRAK1Q9UPV9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRAK1Q9UPV9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRAK1Q9UPV9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRAK1Q9UPV9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRAK1Q9UPV9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRAK1Q9UPV9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRAK1Q9UPV9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRAK1Q9UPV9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRAK1Q9UPV9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRAK1Q9UPV9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRAK1Q9UPV9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRAK1Q9UPV9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRAK1Q9UPV9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRAK1Q9UPV9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRAK1Q9UPV9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRAK1Q9UPV9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRAK1Q9UPV9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
TRAK1Q9UPV9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRAK1Q9UPV9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRAK1Q9UPV9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRAK1Q9UPV9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRAK1Q9UPV9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRAK1Q9UPV9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRAK1Q9UPV9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRAK1Q9UPV9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRAK1Q9UPV9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC33.07■■■□□ 2.89
TRAK1Q9UPV9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRAK1Q9UPV9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRAK1Q9UPV9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRAK1Q9UPV9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
TRAK1Q9UPV9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRAK1Q9UPV9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRAK1Q9UPV9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRAK1Q9UPV9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRAK1Q9UPV9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRAK1Q9UPV9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRAK1Q9UPV9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRAK1Q9UPV9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRAK1Q9UPV9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRAK1Q9UPV9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRAK1Q9UPV9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRAK1Q9UPV9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRAK1Q9UPV9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms