Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMG5Q9UPR3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMG5Q9UPR3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMG5Q9UPR3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMG5Q9UPR3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMG5Q9UPR3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SMG5Q9UPR3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMG5Q9UPR3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMG5Q9UPR3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMG5Q9UPR3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMG5Q9UPR3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMG5Q9UPR3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMG5Q9UPR3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMG5Q9UPR3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMG5Q9UPR3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMG5Q9UPR3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMG5Q9UPR3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMG5Q9UPR3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMG5Q9UPR3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMG5Q9UPR3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMG5Q9UPR3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMG5Q9UPR3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMG5Q9UPR3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMG5Q9UPR3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMG5Q9UPR3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMG5Q9UPR3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMG5Q9UPR3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMG5Q9UPR3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMG5Q9UPR3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMG5Q9UPR3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMG5Q9UPR3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMG5Q9UPR3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMG5Q9UPR3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMG5Q9UPR3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMG5Q9UPR3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMG5Q9UPR3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMG5Q9UPR3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMG5Q9UPR3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMG5Q9UPR3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMG5Q9UPR3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMG5Q9UPR3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMG5Q9UPR3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMG5Q9UPR3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms