Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN11Q9UMQ6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN11Q9UMQ6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN11Q9UMQ6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN11Q9UMQ6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN11Q9UMQ6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN11Q9UMQ6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN11Q9UMQ6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN11Q9UMQ6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN11Q9UMQ6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN11Q9UMQ6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN11Q9UMQ6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN11Q9UMQ6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN11Q9UMQ6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN11Q9UMQ6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN11Q9UMQ6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN11Q9UMQ6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN11Q9UMQ6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN11Q9UMQ6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN11Q9UMQ6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN11Q9UMQ6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN11Q9UMQ6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN11Q9UMQ6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN11Q9UMQ6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN11Q9UMQ6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN11Q9UMQ6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPN11Q9UMQ6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms