Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ALKQ9UM73 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ALKQ9UM73 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ALKQ9UM73 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ALKQ9UM73 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ALKQ9UM73 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ALKQ9UM73 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ALKQ9UM73 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
ALKQ9UM73 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
ALKQ9UM73 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ALKQ9UM73 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
ALKQ9UM73 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ALKQ9UM73 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
ALKQ9UM73 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ALKQ9UM73 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
ALKQ9UM73 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
ALKQ9UM73 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ALKQ9UM73 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
ALKQ9UM73 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
ALKQ9UM73 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC33.79■■■■□ 3
ALKQ9UM73 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
ALKQ9UM73 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ALKQ9UM73 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
ALKQ9UM73 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
ALKQ9UM73 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC33.78■■■■□ 3
ALKQ9UM73 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC33.78■■■■□ 3
ALKQ9UM73 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC33.78■■■■□ 3
ALKQ9UM73 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ALKQ9UM73 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ALKQ9UM73 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ALKQ9UM73 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
ALKQ9UM73 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
ALKQ9UM73 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ALKQ9UM73 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC33.76■■■■□ 3
ALKQ9UM73 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ALKQ9UM73 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ALKQ9UM73 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ALKQ9UM73 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ALKQ9UM73 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ALKQ9UM73 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ALKQ9UM73 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ALKQ9UM73 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ALKQ9UM73 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ALKQ9UM73 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ALKQ9UM73 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ALKQ9UM73 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ALKQ9UM73 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ALKQ9UM73 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ALKQ9UM73 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ALKQ9UM73 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ALKQ9UM73 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ALKQ9UM73 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ALKQ9UM73 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ALKQ9UM73 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ALKQ9UM73 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ALKQ9UM73 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ALKQ9UM73 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ALKQ9UM73 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ALKQ9UM73 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ALKQ9UM73 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ALKQ9UM73 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ALKQ9UM73 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ALKQ9UM73 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
ALKQ9UM73 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ALKQ9UM73 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ALKQ9UM73 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ALKQ9UM73 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ALKQ9UM73 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ALKQ9UM73 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ALKQ9UM73 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ALKQ9UM73 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ALKQ9UM73 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
ALKQ9UM73 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ALKQ9UM73 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
ALKQ9UM73 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
ALKQ9UM73 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ALKQ9UM73 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ALKQ9UM73 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ALKQ9UM73 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ALKQ9UM73 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ALKQ9UM73 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
ALKQ9UM73 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ALKQ9UM73 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ALKQ9UM73 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ALKQ9UM73 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ALKQ9UM73 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ALKQ9UM73 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
ALKQ9UM73 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
ALKQ9UM73 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ALKQ9UM73 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ALKQ9UM73 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ALKQ9UM73 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ALKQ9UM73 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ALKQ9UM73 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ALKQ9UM73 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ALKQ9UM73 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ALKQ9UM73 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ALKQ9UM73 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ALKQ9UM73 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ALKQ9UM73 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms