Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH7Q9ULB5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH7Q9ULB5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH7Q9ULB5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH7Q9ULB5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH7Q9ULB5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH7Q9ULB5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH7Q9ULB5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH7Q9ULB5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH7Q9ULB5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDH7Q9ULB5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDH7Q9ULB5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH7Q9ULB5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH7Q9ULB5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH7Q9ULB5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH7Q9ULB5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH7Q9ULB5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH7Q9ULB5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH7Q9ULB5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH7Q9ULB5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH7Q9ULB5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH7Q9ULB5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH7Q9ULB5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH7Q9ULB5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH7Q9ULB5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH7Q9ULB5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH7Q9ULB5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH7Q9ULB5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH7Q9ULB5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH7Q9ULB5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH7Q9ULB5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH7Q9ULB5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH7Q9ULB5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH7Q9ULB5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH7Q9ULB5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH7Q9ULB5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH7Q9ULB5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH7Q9ULB5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH7Q9ULB5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH7Q9ULB5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH7Q9ULB5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH7Q9ULB5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH7Q9ULB5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH7Q9ULB5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH7Q9ULB5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH7Q9ULB5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH7Q9ULB5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH7Q9ULB5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH7Q9ULB5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH7Q9ULB5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH7Q9ULB5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH7Q9ULB5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH7Q9ULB5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH7Q9ULB5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH7Q9ULB5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH7Q9ULB5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH7Q9ULB5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.3 ms