Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ9

PCOLCE2, Procollagen C-endopeptidase enhancer 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCE2Q9UKZ9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCOLCE2Q9UKZ9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCOLCE2Q9UKZ9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PCOLCE2Q9UKZ9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCOLCE2Q9UKZ9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCOLCE2Q9UKZ9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PCOLCE2Q9UKZ9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PCOLCE2Q9UKZ9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCOLCE2Q9UKZ9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCOLCE2Q9UKZ9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCOLCE2Q9UKZ9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCOLCE2Q9UKZ9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCOLCE2Q9UKZ9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCOLCE2Q9UKZ9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCOLCE2Q9UKZ9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCOLCE2Q9UKZ9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PCOLCE2Q9UKZ9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PCOLCE2Q9UKZ9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCOLCE2Q9UKZ9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCOLCE2Q9UKZ9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCOLCE2Q9UKZ9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCOLCE2Q9UKZ9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCOLCE2Q9UKZ9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCOLCE2Q9UKZ9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCOLCE2Q9UKZ9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCOLCE2Q9UKZ9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCOLCE2Q9UKZ9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCOLCE2Q9UKZ9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCOLCE2Q9UKZ9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCOLCE2Q9UKZ9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCOLCE2Q9UKZ9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCOLCE2Q9UKZ9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCOLCE2Q9UKZ9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCOLCE2Q9UKZ9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCOLCE2Q9UKZ9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PCOLCE2Q9UKZ9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCOLCE2Q9UKZ9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCOLCE2Q9UKZ9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCOLCE2Q9UKZ9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCOLCE2Q9UKZ9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCOLCE2Q9UKZ9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms