Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CASP8AP2Q9UKL3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASP8AP2Q9UKL3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CASP8AP2Q9UKL3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CASP8AP2Q9UKL3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CASP8AP2Q9UKL3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CASP8AP2Q9UKL3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CASP8AP2Q9UKL3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASP8AP2Q9UKL3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASP8AP2Q9UKL3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASP8AP2Q9UKL3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASP8AP2Q9UKL3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASP8AP2Q9UKL3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASP8AP2Q9UKL3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASP8AP2Q9UKL3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASP8AP2Q9UKL3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASP8AP2Q9UKL3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASP8AP2Q9UKL3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASP8AP2Q9UKL3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CASP8AP2Q9UKL3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASP8AP2Q9UKL3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASP8AP2Q9UKL3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASP8AP2Q9UKL3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CASP8AP2Q9UKL3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASP8AP2Q9UKL3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASP8AP2Q9UKL3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CASP8AP2Q9UKL3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CASP8AP2Q9UKL3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CASP8AP2Q9UKL3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CASP8AP2Q9UKL3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CASP8AP2Q9UKL3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CASP8AP2Q9UKL3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CASP8AP2Q9UKL3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASP8AP2Q9UKL3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASP8AP2Q9UKL3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CASP8AP2Q9UKL3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASP8AP2Q9UKL3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASP8AP2Q9UKL3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASP8AP2Q9UKL3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASP8AP2Q9UKL3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CASP8AP2Q9UKL3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASP8AP2Q9UKL3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASP8AP2Q9UKL3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASP8AP2Q9UKL3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASP8AP2Q9UKL3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASP8AP2Q9UKL3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CASP8AP2Q9UKL3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASP8AP2Q9UKL3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASP8AP2Q9UKL3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CASP8AP2Q9UKL3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASP8AP2Q9UKL3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASP8AP2Q9UKL3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASP8AP2Q9UKL3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASP8AP2Q9UKL3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASP8AP2Q9UKL3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASP8AP2Q9UKL3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASP8AP2Q9UKL3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASP8AP2Q9UKL3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASP8AP2Q9UKL3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASP8AP2Q9UKL3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASP8AP2Q9UKL3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASP8AP2Q9UKL3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASP8AP2Q9UKL3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CASP8AP2Q9UKL3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CASP8AP2Q9UKL3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CASP8AP2Q9UKL3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASP8AP2Q9UKL3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASP8AP2Q9UKL3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASP8AP2Q9UKL3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASP8AP2Q9UKL3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASP8AP2Q9UKL3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASP8AP2Q9UKL3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CASP8AP2Q9UKL3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CASP8AP2Q9UKL3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CASP8AP2Q9UKL3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CASP8AP2Q9UKL3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CASP8AP2Q9UKL3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CASP8AP2Q9UKL3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CASP8AP2Q9UKL3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CASP8AP2Q9UKL3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CASP8AP2Q9UKL3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CASP8AP2Q9UKL3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CASP8AP2Q9UKL3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CASP8AP2Q9UKL3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CASP8AP2Q9UKL3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CASP8AP2Q9UKL3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CASP8AP2Q9UKL3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CASP8AP2Q9UKL3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CASP8AP2Q9UKL3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CASP8AP2Q9UKL3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CASP8AP2Q9UKL3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CASP8AP2Q9UKL3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CASP8AP2Q9UKL3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CASP8AP2Q9UKL3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms