Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG4

SLC13A4, Solute carrier family 13 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A4Q9UKG4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC13A4Q9UKG4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms