Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBE1Q9UJT0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBE1Q9UJT0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBE1Q9UJT0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBE1Q9UJT0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBE1Q9UJT0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBE1Q9UJT0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBE1Q9UJT0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBE1Q9UJT0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBE1Q9UJT0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBE1Q9UJT0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBE1Q9UJT0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBE1Q9UJT0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TUBE1Q9UJT0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TUBE1Q9UJT0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TUBE1Q9UJT0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TUBE1Q9UJT0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TUBE1Q9UJT0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TUBE1Q9UJT0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms