Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL4Q9UJQ4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL4Q9UJQ4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL4Q9UJQ4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL4Q9UJQ4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL4Q9UJQ4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL4Q9UJQ4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL4Q9UJQ4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL4Q9UJQ4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL4Q9UJQ4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SALL4Q9UJQ4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SALL4Q9UJQ4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SALL4Q9UJQ4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SALL4Q9UJQ4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SALL4Q9UJQ4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SALL4Q9UJQ4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SALL4Q9UJQ4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SALL4Q9UJQ4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SALL4Q9UJQ4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SALL4Q9UJQ4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SALL4Q9UJQ4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SALL4Q9UJQ4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SALL4Q9UJQ4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SALL4Q9UJQ4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SALL4Q9UJQ4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SALL4Q9UJQ4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SALL4Q9UJQ4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SALL4Q9UJQ4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SALL4Q9UJQ4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SALL4Q9UJQ4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SALL4Q9UJQ4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SALL4Q9UJQ4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SALL4Q9UJQ4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SALL4Q9UJQ4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SALL4Q9UJQ4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SALL4Q9UJQ4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SALL4Q9UJQ4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SALL4Q9UJQ4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SALL4Q9UJQ4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SALL4Q9UJQ4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SALL4Q9UJQ4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SALL4Q9UJQ4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SALL4Q9UJQ4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SALL4Q9UJQ4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SALL4Q9UJQ4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SALL4Q9UJQ4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SALL4Q9UJQ4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SALL4Q9UJQ4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SALL4Q9UJQ4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms