Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MBD1Q9UIS9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms