Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MED13Q9UHV7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED13Q9UHV7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED13Q9UHV7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED13Q9UHV7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED13Q9UHV7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED13Q9UHV7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MED13Q9UHV7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED13Q9UHV7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED13Q9UHV7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED13Q9UHV7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED13Q9UHV7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MED13Q9UHV7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED13Q9UHV7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED13Q9UHV7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED13Q9UHV7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MED13Q9UHV7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED13Q9UHV7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED13Q9UHV7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED13Q9UHV7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED13Q9UHV7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED13Q9UHV7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED13Q9UHV7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED13Q9UHV7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED13Q9UHV7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED13Q9UHV7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED13Q9UHV7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED13Q9UHV7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED13Q9UHV7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MED13Q9UHV7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED13Q9UHV7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED13Q9UHV7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED13Q9UHV7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED13Q9UHV7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED13Q9UHV7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED13Q9UHV7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED13Q9UHV7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED13Q9UHV7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED13Q9UHV7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED13Q9UHV7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED13Q9UHV7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED13Q9UHV7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED13Q9UHV7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MED13Q9UHV7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED13Q9UHV7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED13Q9UHV7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED13Q9UHV7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED13Q9UHV7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED13Q9UHV7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MED13Q9UHV7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED13Q9UHV7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED13Q9UHV7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED13Q9UHV7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED13Q9UHV7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED13Q9UHV7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED13Q9UHV7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED13Q9UHV7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED13Q9UHV7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED13Q9UHV7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED13Q9UHV7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED13Q9UHV7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED13Q9UHV7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED13Q9UHV7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED13Q9UHV7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED13Q9UHV7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED13Q9UHV7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED13Q9UHV7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED13Q9UHV7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms