Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHORDC1Q9UHD1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHORDC1Q9UHD1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHORDC1Q9UHD1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CHORDC1Q9UHD1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHORDC1Q9UHD1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHORDC1Q9UHD1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHORDC1Q9UHD1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHORDC1Q9UHD1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHORDC1Q9UHD1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHORDC1Q9UHD1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHORDC1Q9UHD1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHORDC1Q9UHD1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHORDC1Q9UHD1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHORDC1Q9UHD1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHORDC1Q9UHD1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHORDC1Q9UHD1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CHORDC1Q9UHD1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CHORDC1Q9UHD1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHORDC1Q9UHD1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHORDC1Q9UHD1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHORDC1Q9UHD1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHORDC1Q9UHD1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHORDC1Q9UHD1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHORDC1Q9UHD1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHORDC1Q9UHD1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHORDC1Q9UHD1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHORDC1Q9UHD1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHORDC1Q9UHD1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHORDC1Q9UHD1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHORDC1Q9UHD1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHORDC1Q9UHD1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHORDC1Q9UHD1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CHORDC1Q9UHD1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHORDC1Q9UHD1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHORDC1Q9UHD1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHORDC1Q9UHD1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHORDC1Q9UHD1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHORDC1Q9UHD1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHORDC1Q9UHD1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHORDC1Q9UHD1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.9 ms