Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ASIC3Q9UHC3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ASIC3Q9UHC3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ASIC3Q9UHC3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASIC3Q9UHC3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASIC3Q9UHC3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASIC3Q9UHC3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASIC3Q9UHC3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASIC3Q9UHC3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ASIC3Q9UHC3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASIC3Q9UHC3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASIC3Q9UHC3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASIC3Q9UHC3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASIC3Q9UHC3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASIC3Q9UHC3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASIC3Q9UHC3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ASIC3Q9UHC3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ASIC3Q9UHC3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ASIC3Q9UHC3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ASIC3Q9UHC3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ASIC3Q9UHC3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ASIC3Q9UHC3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ASIC3Q9UHC3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ASIC3Q9UHC3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ASIC3Q9UHC3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ASIC3Q9UHC3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASIC3Q9UHC3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASIC3Q9UHC3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASIC3Q9UHC3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASIC3Q9UHC3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASIC3Q9UHC3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ASIC3Q9UHC3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ASIC3Q9UHC3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ASIC3Q9UHC3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ASIC3Q9UHC3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ASIC3Q9UHC3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ASIC3Q9UHC3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ASIC3Q9UHC3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ASIC3Q9UHC3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ASIC3Q9UHC3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ASIC3Q9UHC3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ASIC3Q9UHC3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ASIC3Q9UHC3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ASIC3Q9UHC3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ASIC3Q9UHC3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ASIC3Q9UHC3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ASIC3Q9UHC3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ASIC3Q9UHC3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ASIC3Q9UHC3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ASIC3Q9UHC3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASIC3Q9UHC3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASIC3Q9UHC3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ASIC3Q9UHC3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASIC3Q9UHC3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASIC3Q9UHC3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASIC3Q9UHC3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASIC3Q9UHC3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASIC3Q9UHC3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASIC3Q9UHC3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASIC3Q9UHC3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms