Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB7

AFF4, AF4/FMR2 family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF4Q9UHB7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AFF4Q9UHB7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AFF4Q9UHB7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AFF4Q9UHB7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AFF4Q9UHB7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AFF4Q9UHB7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AFF4Q9UHB7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AFF4Q9UHB7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
AFF4Q9UHB7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
AFF4Q9UHB7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AFF4Q9UHB7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
AFF4Q9UHB7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AFF4Q9UHB7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AFF4Q9UHB7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AFF4Q9UHB7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFF4Q9UHB7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFF4Q9UHB7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFF4Q9UHB7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFF4Q9UHB7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFF4Q9UHB7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AFF4Q9UHB7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AFF4Q9UHB7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
AFF4Q9UHB7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AFF4Q9UHB7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFF4Q9UHB7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFF4Q9UHB7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
AFF4Q9UHB7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFF4Q9UHB7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFF4Q9UHB7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AFF4Q9UHB7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AFF4Q9UHB7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFF4Q9UHB7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFF4Q9UHB7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFF4Q9UHB7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFF4Q9UHB7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFF4Q9UHB7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
AFF4Q9UHB7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFF4Q9UHB7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AFF4Q9UHB7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AFF4Q9UHB7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AFF4Q9UHB7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.9 ms