Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FBXO40Q9UH90 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FBXO40Q9UH90 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FBXO40Q9UH90 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FBXO40Q9UH90 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FBXO40Q9UH90 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FBXO40Q9UH90 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FBXO40Q9UH90 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FBXO40Q9UH90 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FBXO40Q9UH90 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FBXO40Q9UH90 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FBXO40Q9UH90 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FBXO40Q9UH90 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FBXO40Q9UH90 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FBXO40Q9UH90 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FBXO40Q9UH90 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FBXO40Q9UH90 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FBXO40Q9UH90 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FBXO40Q9UH90 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FBXO40Q9UH90 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FBXO40Q9UH90 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FBXO40Q9UH90 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FBXO40Q9UH90 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FBXO40Q9UH90 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FBXO40Q9UH90 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FBXO40Q9UH90 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FBXO40Q9UH90 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FBXO40Q9UH90 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FBXO40Q9UH90 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FBXO40Q9UH90 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FBXO40Q9UH90 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FBXO40Q9UH90 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FBXO40Q9UH90 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FBXO40Q9UH90 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FBXO40Q9UH90 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FBXO40Q9UH90 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FBXO40Q9UH90 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FBXO40Q9UH90 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms