Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH03

SEPT3, Neuronal-specific septin-3, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT3Q9UH03 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SEPT3Q9UH03 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SEPT3Q9UH03 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SEPT3Q9UH03 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEPT3Q9UH03 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEPT3Q9UH03 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEPT3Q9UH03 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEPT3Q9UH03 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEPT3Q9UH03 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEPT3Q9UH03 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms