Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ5

EIF3K, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3KQ9UBQ5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EIF3KQ9UBQ5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms