Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MBD2Q9UBB5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 325.2 ms