Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGAP28Q9P2N2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARHGAP28Q9P2N2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARHGAP28Q9P2N2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ARHGAP28Q9P2N2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARHGAP28Q9P2N2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGAP28Q9P2N2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGAP28Q9P2N2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGAP28Q9P2N2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGAP28Q9P2N2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGAP28Q9P2N2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGAP28Q9P2N2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGAP28Q9P2N2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARHGAP28Q9P2N2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARHGAP28Q9P2N2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARHGAP28Q9P2N2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARHGAP28Q9P2N2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARHGAP28Q9P2N2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARHGAP28Q9P2N2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGAP28Q9P2N2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGAP28Q9P2N2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGAP28Q9P2N2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGAP28Q9P2N2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGAP28Q9P2N2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGAP28Q9P2N2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGAP28Q9P2N2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGAP28Q9P2N2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGAP28Q9P2N2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGAP28Q9P2N2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGAP28Q9P2N2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGAP28Q9P2N2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGAP28Q9P2N2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGAP28Q9P2N2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARHGAP28Q9P2N2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARHGAP28Q9P2N2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARHGAP28Q9P2N2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARHGAP28Q9P2N2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARHGAP28Q9P2N2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARHGAP28Q9P2N2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARHGAP28Q9P2N2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARHGAP28Q9P2N2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARHGAP28Q9P2N2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARHGAP28Q9P2N2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARHGAP28Q9P2N2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARHGAP28Q9P2N2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARHGAP28Q9P2N2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARHGAP28Q9P2N2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGAP28Q9P2N2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms