Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF9Q9P2J2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF9Q9P2J2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF9Q9P2J2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF9Q9P2J2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF9Q9P2J2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF9Q9P2J2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF9Q9P2J2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF9Q9P2J2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF9Q9P2J2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF9Q9P2J2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF9Q9P2J2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF9Q9P2J2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF9Q9P2J2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF9Q9P2J2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF9Q9P2J2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms