Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HMG20BQ9P0W2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HMG20BQ9P0W2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
HMG20BQ9P0W2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HMG20BQ9P0W2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HMG20BQ9P0W2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HMG20BQ9P0W2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
HMG20BQ9P0W2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
HMG20BQ9P0W2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HMG20BQ9P0W2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
HMG20BQ9P0W2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
HMG20BQ9P0W2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
HMG20BQ9P0W2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
HMG20BQ9P0W2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HMG20BQ9P0W2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HMG20BQ9P0W2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HMG20BQ9P0W2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HMG20BQ9P0W2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HMG20BQ9P0W2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HMG20BQ9P0W2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HMG20BQ9P0W2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HMG20BQ9P0W2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
HMG20BQ9P0W2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
HMG20BQ9P0W2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HMG20BQ9P0W2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HMG20BQ9P0W2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HMG20BQ9P0W2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HMG20BQ9P0W2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HMG20BQ9P0W2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HMG20BQ9P0W2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
HMG20BQ9P0W2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HMG20BQ9P0W2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HMG20BQ9P0W2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HMG20BQ9P0W2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HMG20BQ9P0W2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HMG20BQ9P0W2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HMG20BQ9P0W2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HMG20BQ9P0W2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HMG20BQ9P0W2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HMG20BQ9P0W2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HMG20BQ9P0W2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HMG20BQ9P0W2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HMG20BQ9P0W2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HMG20BQ9P0W2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
HMG20BQ9P0W2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HMG20BQ9P0W2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HMG20BQ9P0W2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
HMG20BQ9P0W2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HMG20BQ9P0W2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HMG20BQ9P0W2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HMG20BQ9P0W2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HMG20BQ9P0W2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HMG20BQ9P0W2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms