Protein–RNA interactions for Protein: Q9P086

MED11, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED11Q9P086 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED11Q9P086 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MED11Q9P086 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED11Q9P086 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED11Q9P086 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED11Q9P086 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED11Q9P086 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED11Q9P086 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED11Q9P086 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED11Q9P086 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED11Q9P086 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED11Q9P086 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED11Q9P086 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED11Q9P086 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MED11Q9P086 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED11Q9P086 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED11Q9P086 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MED11Q9P086 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms