Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMCD1Q9NZU5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMCD1Q9NZU5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMCD1Q9NZU5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMCD1Q9NZU5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMCD1Q9NZU5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMCD1Q9NZU5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMCD1Q9NZU5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMCD1Q9NZU5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMCD1Q9NZU5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMCD1Q9NZU5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMCD1Q9NZU5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMCD1Q9NZU5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMCD1Q9NZU5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMCD1Q9NZU5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMCD1Q9NZU5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMCD1Q9NZU5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMCD1Q9NZU5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LMCD1Q9NZU5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LMCD1Q9NZU5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMCD1Q9NZU5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMCD1Q9NZU5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMCD1Q9NZU5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMCD1Q9NZU5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMCD1Q9NZU5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMCD1Q9NZU5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMCD1Q9NZU5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMCD1Q9NZU5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LMCD1Q9NZU5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LMCD1Q9NZU5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMCD1Q9NZU5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LMCD1Q9NZU5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMCD1Q9NZU5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMCD1Q9NZU5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMCD1Q9NZU5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMCD1Q9NZU5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMCD1Q9NZU5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMCD1Q9NZU5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMCD1Q9NZU5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMCD1Q9NZU5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMCD1Q9NZU5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LMCD1Q9NZU5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMCD1Q9NZU5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMCD1Q9NZU5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMCD1Q9NZU5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMCD1Q9NZU5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMCD1Q9NZU5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMCD1Q9NZU5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMCD1Q9NZU5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMCD1Q9NZU5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMCD1Q9NZU5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LMCD1Q9NZU5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LMCD1Q9NZU5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
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