Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
C9orf78Q9NZ63 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
C9orf78Q9NZ63 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
C9orf78Q9NZ63 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
C9orf78Q9NZ63 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
C9orf78Q9NZ63 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
C9orf78Q9NZ63 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
C9orf78Q9NZ63 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
C9orf78Q9NZ63 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
C9orf78Q9NZ63 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
C9orf78Q9NZ63 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
C9orf78Q9NZ63 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
C9orf78Q9NZ63 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
C9orf78Q9NZ63 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
C9orf78Q9NZ63 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
C9orf78Q9NZ63 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
C9orf78Q9NZ63 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
C9orf78Q9NZ63 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
C9orf78Q9NZ63 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
C9orf78Q9NZ63 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
C9orf78Q9NZ63 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
C9orf78Q9NZ63 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
C9orf78Q9NZ63 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
C9orf78Q9NZ63 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
C9orf78Q9NZ63 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
C9orf78Q9NZ63 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
C9orf78Q9NZ63 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
C9orf78Q9NZ63 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
C9orf78Q9NZ63 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
C9orf78Q9NZ63 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
C9orf78Q9NZ63 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
C9orf78Q9NZ63 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
C9orf78Q9NZ63 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
C9orf78Q9NZ63 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
C9orf78Q9NZ63 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
C9orf78Q9NZ63 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
C9orf78Q9NZ63 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
C9orf78Q9NZ63 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
C9orf78Q9NZ63 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
C9orf78Q9NZ63 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
C9orf78Q9NZ63 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
C9orf78Q9NZ63 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
C9orf78Q9NZ63 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
C9orf78Q9NZ63 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
C9orf78Q9NZ63 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
C9orf78Q9NZ63 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
C9orf78Q9NZ63 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
C9orf78Q9NZ63 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
C9orf78Q9NZ63 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
C9orf78Q9NZ63 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
C9orf78Q9NZ63 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
C9orf78Q9NZ63 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
C9orf78Q9NZ63 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
C9orf78Q9NZ63 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
C9orf78Q9NZ63 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
C9orf78Q9NZ63 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
C9orf78Q9NZ63 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
C9orf78Q9NZ63 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
C9orf78Q9NZ63 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
C9orf78Q9NZ63 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
C9orf78Q9NZ63 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
C9orf78Q9NZ63 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
C9orf78Q9NZ63 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
C9orf78Q9NZ63 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
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